Lễ bốc thăm vòng 3 sẽ được tổ chức vào lúc 1/7/2021 (tại khách sạn Mandarin Oriental ở Kuala Lumpur, Malaysia) thay vì 24/6/2021 như dự kiến.

Các đội hạt giống đã được công bố dựa trên bảng xếp hạng FIFA của ngày 18/6/2021. 12 đội được chia thành 2 bảng, mỗi bảng có một đội từ mỗi nhóm trong 6 nhóm. Lịch thi đấu của mỗi bảng sẽ được tự động quyết định dựa trên nhóm tương ứng của mỗi đội.

Do đại dịch COVID-19 tại châu Á, FIFA đã thông báo vào ngày 12 tháng 8 năm 2020 rằng các trận đấu vòng loại sắp tới dự kiến vào năm 2020 đã được chuyển sang năm 2021, và vào ngày 11 tháng 11, Ủy ban thi đấu AFC cũng thông báo rằng vòng cuối cùng của vòng loại châu Á sẽ bắt đầu vào tháng 9 năm 2021 và sẽ kết thúc vào tháng 3 năm 2022. Tuy nhiên, đây vẫn mới chỉ là dự kiến.

Hai đội đứng đầu mỗi bảng vòng loại thứ 3 sẽ giành quyền tham dự vòng chung kết FIFA World Cup 2022. Hai đội đứng thứ ba sẽ vào vòng 4.

Ở vòng 4, hai đội đứng thứ 3 mỗi bảng sẽ thi đấu play-off một trận vào tháng 5 hoặc tháng 6 năm 2022. Thành phố đăng cai và địa điểm tổ chức trận đấu này sẽ được công bố trong lễ bốc thăm vòng 3.

Đội thắng trận này sẽ tham gia loạt trận play-off liên lục địa. Bốn đội từ 4 liên đoàn (AFC, CONCACAF, CONMEBOL và OFC) sẽ được bốc thăm thành hai cặp đấu.

Trong mỗi trận đấu, hai đội sẽ đá hai lượt trận sân nhà và sân khách. Hai đội chiến thắng, được quyết định dựa trên tỷ số chung cuộc, sẽ tham dự FIFA World Cup 2022 tại Qatar. Nếu tổng điểm bằng nhau, luật bàn thắng sân khách sẽ được áp dụng, tức là đội ghi được nhiều bàn thắng hơn trên sân khách trong hai lượt trận sẽ đi tiếp. Nếu bàn thắng trên sân khách cũng bằng nhau, thì 30 phút hiệp phụ sẽ được thi đấu. Luật bàn thắng sân khách một lần nữa được áp dụng sau hiệp phụ, tức là nếu có bàn thắng được ghi trong hiệp phụ và tỷ số chung cuộc vẫn bằng nhau, đội khách sẽ đi tiếp nhờ ghi được nhiều bàn thắng hơn trên sân khách. Nếu không có bàn thắng nào được ghi trong hiệp phụ, cặp đấu sẽ được quyết định bằng loạt sút luân lưu.