Liên quan đến hành vi phạm tội của bị cáo Phan Mạnh Cường có: Bị cáo Mã Văn Huy (SN 1978), cựu Trưởng phòng Quản lý đầu tư và doanh nghiệp, thuộc Ban Quản lý các KCN Thái Nguyên bị xét xử về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí”; bị cáo Nông Quốc Tiến (SN 1964), cựu Trưởng phòng Quản lý quy hoạch - xây dựng, thuộc Ban Quản lý các KCN Thái Nguyên, bị xét xử về tội “Thiếu trách nhiệm gây thiệt hại đến tài sản của Nhà nước”; bị cáo Nguyễn Vũ Huy (SN 1986), cựu nhân viên Phòng Quản lý quy hoạch - xây dựng, thuộc Ban Quản lý các KCN Thái Nguyên, bị xét xử về tội “Thiếu trách nhiệm gây thiệt hại đến tài sản của Nhà nước”.

Theo cáo trạng của Viện Kiểm sát Nhân dân (KSND) tỉnh Thái Nguyên, Ban Quản lý các KCN Thái Nguyên là cơ quan trực thuộc UBND tỉnh Thái Nguyên, thực hiện chức năng quản lý Nhà nước trực tiếp đối với các KCN trên địa bàn tỉnh Thái Nguyên. Đồng thời quản lý và tổ chức thực hiện chức năng cung cấp dịch vụ hành chính công, dịch vụ hỗ trợ khác có liên quan đến hoạt động đầu tư, sản xuất kinh doanh trong các KCN.

Ngày 24/10/2011, UBND tỉnh Thái Nguyên đã ra Quyết định số 2638/QĐ-UBND phê duyệt Dự án đầu tư xây dựng công trình KCN Điềm Thụy với diện tích 180 ha (năm 2017 được đổi tên thành Dự án xây dựng KCN Điềm Thụy - Khu A) và giao cho Ban Quản lý các KCN làm chủ đầu tư. Tổng mức đầu tư của dự án là hơn 1.400 tỷ đồng, trong đó nguồn vốn đầu tư lấy từ vốn ngân sách Nhà nước và các nguồn vốn khác.

Ban Quản lý các KCN được UBND tỉnh Thái Nguyên giao trực tiếp quản lý, sử dụng vốn ngân sách Nhà nước và các nguồn vốn khác để thực hiện hoạt động đầu tư xây dựng công trình.

Ngày 30/5/2014, UBND tỉnh Thái Nguyên thành lập Ban Quản lý các dự án đầu tư xây dựng KCN, trực thuộc Ban Quản lý các KCN Thái Nguyên. Ban Quản lý các dự án là đơn vị sự nghiệp công lập, có chức năng giúp Ban Quản lý các KCN Thái Nguyên (chủ đầu tư) thực hiện nhiệm vụ do chủ đầu tư giao, và quyền hạn do chủ đầu tư ủy quyền theo quy định của pháp luật.

Trong quá trình thực hiện dự án đầu tư xây dựng công trình, ký hợp đồng cho thuê lại đất tại KCN Điềm Thụy, bị cáo Phan Mạnh Cường (khi đó là Trưởng ban Quản lý các KCN Thái Nguyên, kiêm Giám đốc Ban Quản lý các dự án đầu tư xây dựng KCN, giai đoạn 2013 - 2019) và một số cá nhân có trách nhiệm thuộc Ban Quản lý các KCN đã có hành vi vi phạm pháp luật, gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước.

Năm 2014, trong quá trình đầu tư xây dựng hạng mục san lấp mặt bằng mở rộng lô CN 3, diện tích 4,5 ha thuộc Dự án xây dựng KCN Điềm Thụy, các bị cáo: Phan Mạnh Cường, Nông Quốc Tiến và Nguyễn Vũ Huy đã có hành vi thiếu trách nhiệm, không thực hiện đúng quy định của pháp luật về đầu tư xây dựng công trình, nghiệm thu hoàn thành công trình và lập báo cáo quyết toán dự án hoàn thành đối với gói thầu khi vẫn còn phần diện tích (2.347 m2) và khối lượng (26.269 m3 phần đào và 29,1 m3 phần đắp) chưa được thi công hoàn thành như hồ sơ thiết kế thi công và quyết toán đã được thẩm tra, phê duyệt, gây thiệt hại cho Nhà nước số tiền gần 1,6 tỷ đồng.

Trong thời gian từ năm 2014 - 2018, mặc dù biết rõ theo quy định của pháp luật về quản lý đất đai khi ký hợp đồng cho thuê đất phải áp dụng mức giá còn hiệu lực tại thời điểm ký hợp đồng, không được lấy mức giá tại thời điểm thỏa thuận với các nhà đầu tư (mức giá đã hết hiệu lực áp dụng) làm mức giá để ký hợp đồng, nhưng bị cáo Phan Mạnh Cường đã chỉ đạo bị cáo Mã Văn Huy soạn thảo và ký kết hợp đồng cho thuê lại đất đối với 9 nhà đầu tư.

Trong hợp đồng, bị cáo Phan Mạnh Cường và bị cáo Mã Văn Huy không áp dụng mức giá cho thuê đất tại quyết định phê duyệt giá đất của UBND tỉnh Thái Nguyên còn hiệu lực, mà áp dụng mức giá cho thuê đất tại quyết định phê duyệt giá đất không còn hiệu lực tại thời điểm ký hợp đồng, qua đó gây thiệt hại của Nhà nước số tiền lớn.

Cơ quan tố tụng xác định, bị cáo Phan Mạnh Cường phải chịu trách nhiệm chính đối với những sai phạm và thiệt hại trong vụ án. Các bị cáo khác chịu trách nhiệm với vai trò đồng phạm.